Chkrootkit, herramienta ideal para eliminar rootkits desde X windows

http://www.chkrootkit.org/

En Ubuntu Linux descomprimir, y en el directorio (yo uso Nautilus Terminal) ejecutar
sudo make sense
sudo ./chkrootkit

Puede que si elimina alguno bloquee el equipo después y tengas que reiniciar. En ese caso vuelve a descomprimirlo en otro directorio y vuelve a crearlo y ejecutarlo. comprueba la relativamente extensa salida para comprobar que no haya detectado ningún troyano o rootkit.